plantlist包

比较老了，数据可能比较旧

github网址

张金龙博客介绍

##引用
> citation("plantlist")

Jinlong Zhang, Bing Liu, Su Liu, Zhenhao Feng and Kaiwen Jiang  (2021). plantlist: Looking Up the Status of Plant Scientific  Names based on The Plant List Database, Search the Chinese  Names and Making checklists of plants. R package version 0.7.2.  <https://github.com/helixcn/plantlist/>

#查询植物
CTPL("桃儿七",print_as_list =F)

LPSC包

采用2022最新植物志名录

https://github.com/helixcn/LPSC

library(LPSC)
get_accepted_name("银杏")

#使用LPSC包查询匹配植物列表
library(LPSC)
library(openxlsx)
testdat <- read.xlsx("sample_checklist_to_clean.xlsx")
# 查询多个学名的接受名## 要使用get_accepted_name，则先要生成能用于查询的学名（不能有命名人）
scientific_name_parsed <- plantlist::parse_taxa(testdat$Chinese_name)# 因有命名人，所以先parse
names_to_search <- paste(scientific_name_parsed$GENUS_PARSED,
      scientific_name_parsed$SPECIES_PARSED,
      scientific_name_parsed$INFRASPECIFIC_RANK_PARSED,
      scientific_name_parsed$INFRASPECIFIC_EPITHET_PARSED)## 查询
res_LPSC_2022_accepted_names <- get_accepted_name(names_to_search)## 保存结果
write.xlsx(res_LPSC_2022_accepted_names,
           "res_LPSC_2022_accepted_names.xlsx")

WorldFlora包

Kindt, R. 2020. WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online taxonomic backbone data. Applications in Plant Sciences  8( 9): e11388.https://doi.org/10.1002/aps3.11388

不太会用